如何高效获得药物模拟

        想象能够利用PC和一些熟手的软件就能发现最新的带来轰动的药物。这听起来一点都不夸张。芯片实验室（工业上的和高校中）的数量正在增加，它们可以模拟从细胞到临床试验的所有东西。这将带来医药研究上的巨大变化，以前指定在工作台上进行的工作现在可以用具有时钟周期的中央处理单元上进行。

        这种变化主要是因为传统药物发现方法的低效导致的。一次又一次，数以百亿的美元用于有希望的候选药物开发，但是最后在临床晚期试验中以失败告终。“这个行业是建立在成功的基础上的，当然，也是由失败塑造而成的。”

        来自牛津UK-based  Physiomics  的执行总监John  Savin说。计算机建模公司坚信利用他们的方法可以帮助医药公司早日走出失败，并且能帮助他们把努力集中于最有希望的候选药物上。

        让我们看看强生公司医药信息学的主管Richard  Ho的经历。他通过加州福斯特市Entelos公司的PhysioLab技术来不断改进公司在药物开发上进行的努力。Entelos公司的生物模拟技术能将关于某种特疾病的公开数据翻译成数字信号，然后询问相应的模型来确定假设是否正确和药物是否有效。

        Ho带领的小组将研究聚焦于糖尿病，他们检测参与葡萄糖调节的一种蛋白的抑制剂的长期效果，这些抑制剂是十分有前景的。他们发现随着治疗时间的延长，这些抑制剂早期带来的效果逐渐消失。“所以对于像糖尿病这样的疾病来说，这将不是一种有用的治疗方法。”Ho说。结果人力和物力将转移到更进一步的研究另外的靶标中。

        指导药物开发

        Entelos公司只是众多以发展芯片市场为目标的公司中的一员。加州Pharsight  of  Mountain  View公司摸拟临床试验设计来帮助医药研究者们确定最有效的临床试验策略。Pharsight公司的高级科学顾问Jaap  Mandema解释说传统的临床试验主要围绕单个假设而建立  ，并且公司并不总是调整临床策略使其适应每个临床阶段得到的信息。

        Pharsight公司的临床模拟器能够合并所要研究的化合物的潜在资料、竞争药物的临床资料与市场资料，对不同的临床试验设计进行定量的概率模拟。“你可以在这种试验结束进行决策时得到关于安全性、功效、生物标记物和其它方面的信息。”他说。“我们得到了针对特定临床试验的进行的模拟设计与你能在该模拟试验结束后所做决定的好坏的关系。”

        模拟同样可以帮助药物开发的早期实验阶段。新泽西州的BioAnalytics  Group  of  Hightstown公司设计了真实的细胞基础上分析来帮助研究者们设计实验，而不是完全取代工作台上的工作，该公司的模型基础上的分析系统为传统的实验服务。

        数以百万计的模拟实验可以在单个传统实验所需的时间内完成，这将帮助研究人员决定哪一种情况应该在实验室中进行实验验证。该公司的合创者G.  Scott  Lett说，科学家们可以通过模拟实验过滤数据，以便在大量的真实实验数据无法解释的清况下进行分析。他补充说，一些医药公司已经利用模型基础的分析法成功地划分候选药物的优先次序，并且能测定候选药物的作用机制。（生物通：亚历） (责任编辑：泉水)

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