美国伊利诺伊大学香槟分校的研究人员发明了可揭示细菌基因组中沉默基因的功能的新方法，称为DNA汇编法（DNA assembler），该研究成果于2013年12月5日发表在《自然·通讯》（Nature Communications）杂志上。

细菌基因组控制着细菌体内天然抗生素及其它对医疗有重要作用的代谢物的合成，编码合成这些代谢物的酶的基因常成簇分布。这些代谢物可被筛选、分离，进行结构和功能分析。细菌在特定的环境中，只表达特定的基因，这对细菌本身来说可以节省能量，但是不利于研究人员发现新的代谢产物。因此迄今为止发现的代谢物仍只是一小部分。

研究人员表示，细菌基因组中有很多沉默基因没有被发现，需要新的环境信号诱导其表达。研究人员采用各种极端的培养环境培养细菌或者把一个菌种的基因插入另一个菌种，试图诱导不同基因的表达。该研究组基于此构建了DNA assembler的实验方法。该方法是将DNA的启动子小片段插入沉默基因簇的基因间隙，由此判断哪些基因可以表达。该方法为每个基因簇中的基因加一个启动子，确保每个基因都被激活。该研究通过灰色链霉菌实验对DNA assembler进行检测。对灰色链霉菌一个含有六个基因的基因簇做修饰，在基因簇中的每个基因前面加上一个启动子，增强基因表达，且在基因簇中插入相关外源基因，灰色链霉菌仍可以很好的生存，表达了以前沉默的基因，产生了以前未发现的多环芳烃族（PTMs）代谢物。

该方法向构建具有高普遍意义的、自动的、高通量的研究代谢物的方法迈出重要一步。

张永娟 编译自http://www.sciencedaily.com/releases/2013/12/131205142129.htm