新研究指出，安全实验室保存下来的天花正式消灭前历年的样品显示，天花的遗传多样性很低。Joseph  Esposito和同事说，45个分离出的不同天花病毒株的DNA序列几乎是一样的。尽管有高度的类似性，但是他们的分析也提出了病毒的三个主要进化分支：西非洲、亚洲、和南美洲。通过重建这些进化分支以及确定这些毒株导致不同死亡率的蛋白差异，研究为改进诊断化验以及药物治疗提供了基础数据。