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单细胞与空间组学 从“果汁”到“果盘”：单细胞RNA测序（scRNA-seq）核心原理与新手入门指南

本文详细介绍了单细胞RNA测序（scRNA-seq）的核心原理、技术流程及新手入门指南。通过生动的比喻解释了单细胞测序与批量测序的区别，阐述了液滴微流控技术的三大关键步骤，并提供了实验设计、样本制备和数据分析的实用建议，帮助研究者掌握这一革命性技术。...

2026-04-18 14:43:57 197

单细胞与空间组学 剑桥大学单细胞RNA-seq数据分析课程

剑桥大学开设的单细胞RNA-seq数据分析课程，系统讲解从实验设计到高级分析的全流程，包括质量控制、标准化、降维、聚类、差异表达、轨迹推断等核心内容。课程基于R语言，提供Docker镜像确保可复现性，开源共享，适合生物信息学研究人员和实验生物学家学习。...

2026-04-18 13:14:15 110

单细胞与空间组学 SEPAR：空间转录组与多组学数据中空间元基因发现与分子模式表征的新利器

空间转录组学技术虽能高分辨率解析基因表达，但提取有意义的分子模式仍是挑战。SEPAR框架通过元基因视角简化数据，识别空间协同表达的基因集合，并表征其分布模式。在肿瘤组织中，SEPAR成功识别与免疫浸润和微环境重塑相关的分子模式，与预后相关。该算法兼顾效率与可解释性，为空间组学提供标准化分析流程。...

2026-04-12 18:54:47 65

单细胞与空间组学 Seq-Scope-eXpanded：突破光学极限的超高分辨率空间组学技术

本文介绍了一种名为Seq-Scope-eXpanded（SS-eXpanded）的创新空间组学技术，该技术将扩增显微镜与Seq-Scope空间转录组测序相结合，突破了光学衍射极限，实现了亚细胞层面的纳米级分辨率。通过物理扩增样本，SS-eXpanded能够解析细胞内不同区室的转录组差异，揭示传统方法无法检测的微小空间异质性。该技术为研究复杂生物过程中的空间调控机制提供了新工具，有望推动疾病诊断和药物研发。...

2026-04-11 13:01:48 110

单细胞与空间组学 FineST：基于对比学习的组织学与空间转录组整合框架，实现细胞核分辨率的配体

FineST是一种创新的计算框架，通过对比学习整合组织学图像与空间转录组数据，成功实现细胞核分辨率的基因表达解析。该方法在多种组织样本中验证了其高效性，能够精确识别细胞亚型并进行高分辨率的配体-受体相互作用分析，为肿瘤微环境和疾病机制研究提供了强有力的工具支持。...

2026-04-11 09:36:20 215

单细胞与空间组学 新方法可将细胞活动拍成“动态短片”

美国哈佛大学医学院和瑞典卡罗林斯卡医学院的研究人员开发出一种新方法，通过分析细胞内mRNA的动态变化，将细胞活动的静态快照转变为动态短片，预测细胞未来几小时内的状态。该方法基于数学模型，准确性极高，有助于深入理解器官发育、药物反应及神经发育障碍如精神分裂症和自闭症。...

2018-08-10 14:13:18 107

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