传统上,识别神经元类型就像通过树叶识别树木——这是一个基于形态(形状)的手动、缓慢的过程。现在,研究人员开发了一种新的人工智能系统NTAC,证明神经元的“连接图谱”(即它和谁通信)比其物理外观更准确地定义其类型。该系统在普通笔记本电脑上几分钟内即可对数千个神经元进行分类,准确率超过90%,即使在神经元外观相同的脑区也同样有效。
研究背景:形态分类的局限性
随着电子显微镜和计算机视觉技术的进步,研究者已经能够重建小型动物大脑的完整连接组(即神经元与突触连接的网络)。然而,对这些连接组进行精确的细胞分型——解释回路功能、比较不同物种的大脑组织——却成为新的瓶颈。
传统的细胞分型依赖专家手动进行形态学分类,这是一个缓慢的过程,且需要详细的解剖信息。更重要的是,在许多脑区,尤其是在具有重复细胞类型的回路中,不同功能的神经元可能形态非常相似,仅靠外形进行判断具有欺骗性且不可靠。
NTAC系统:基于连接性的分类方法
在一项国际合作研究中,来自日本先端科学技术大学院大学(JAIST)、普林斯顿神经科学研究所、爱丁堡大学和加泰罗尼亚理工大学的研究团队开发了NTAC(从连接性进行神经元类型分配)系统。该系统证明,仅凭突触连接信息就足以高精度地识别神经元类型,无需依赖形态特征。
NTAC具有两种运行模式:
| 模式 | 说明 | 应用场景 |
|---|---|---|
| 半监督模式 | 利用一小部分已标记的神经元作为“种子”,通过连接模式推断其余所有神经元的类型 | 已有部分已知类型数据时使用 |
| 无监督模式 | 无需任何预先标记,纯粹基于连接模式的相似性将神经元聚类为不同类型 | 对新脑区进行探索性分类 |
性能表现:远超传统形态学方法
研究团队将NTAC应用于多个最先进的果蝇大脑连接组,并与基于形态学的NBLAST方法(一种广泛使用的神经元形状比较方法)进行了对比。
| 测试场景 | NTAC准确率 | 形态学方法准确率 |
|---|---|---|
| 果蝇视叶(神经元形态极其相似) | >90% | <50% |
| 全脑无监督模式 | 52% | <10% |
| 复杂区域无监督模式 | ~70% | 通常低于10% |
更重要的是,NTAC仅需极少量的标记样本(半监督模式)或完全无需标记(无监督模式),在普通笔记本电脑上几分钟内即可完成数千个神经元的分类,而传统方法需要专家数月的劳动。
科学意义:连接组学的新里程碑
“我们的研究正值连接组数据快速增长、对自动化和可扩展工具的需求日益迫切之际,”研究负责人、JAIST副教授Gregory Schwartzman博士表示。“NTAC表明,连接图谱本身就包含了足够的信息,可以快速识别神经元类型,即使只有极小部分神经元被标记。”
研究团队将这一突破与基因组学的兴起相类比:正如绘制人类基因组图谱彻底改变了生物学和医学,绘制完整的“连接组”图谱将可能揭示脑回路在疾病中如何失效,并为理解大脑功能提供全新框架。
应用与未来
NTAC已成功应用于果蝇“大脑-神经索连接组”(BANC)数据集,对数以千计的神经元进行了标记。下一步,研究团队计划将该算法应用于小鼠大脑连接组的绘制——这是连接组学的下一个前沿领域。未来,随着技术向人类大脑(拥有860亿个神经元)迈进,NTAC这类自动化工具将成为处理海量数据的唯一可行途径。
研究人员表示,未来通过整合多模态数据(如基因表达、电生理特性),可进一步提升分类性能,获得对神经元类型更全面的理解。
研究信息
Original Research: Open access.
“NTAC: Neuronal type assignment from connectivity” by Gregory Schwartzman, Ben Jourdan, David García-Soriano & Arie Matsliah. Nature Communications
DOI:10.1038/s41467-025-68044-1
总结
NTAC系统颠覆了传统依赖形态的神经元分类范式,证明连接性是定义神经元类型的更本质特征。其高效、准确、可在普通计算设备上运行的特点,为大规模连接组数据分析提供了关键工具。这一进展不仅加速了果蝇等模式生物脑图谱的构建,也为未来绘制小鼠乃至人类大脑连接组铺平了道路,有望推动对神经发育障碍、精神疾病等脑疾病的机制理解。