NTSYS-PC使用说明

草履虫

1、生成矩阵：在excel按如下规则输入数据，A1=1表示有带记为1，B1=13表示扩增的总条带数， C1=7表示样本数，D1=0表示无带记为0。第二行表示的是样本名称。从第三行开始的A列表示引物名称。见下图：

 输入完毕后，将文件以Microsoft excel 5.0/95工作薄的格式存盘。

 2、生成系统树： 打开NTSYS-PC程序，点击similarity出现如下界面：

再点击Qualitative data，出现下面的界面：

点击input file，打开生成的excel文件，点击out file起一个文件名（假设叫A），然后点击compute按钮。继续点击clustering，出现下面的界面，

 

再点SHAN，出现如下界面：

 

点击input file，打开文件A，点击out file起一个文件名（假设叫B），然后点击compute按钮。然后点Graphics

 

再点tree plot，出现下面的界面：

 

点击input file，打开文件B，然后点击compute按钮，就会出现聚类图。

 

3、生成遗传相似度表： 点File中的Edit file,打开文件A，再点compute按钮，就会得到遗传相似度表。

这个软件的功能很强大，但我也只会做聚类图和遗传相似度，如果其他朋友还会使用其它功能，请多交流。