2013年8月26日，岛津宣布推出GC/MS代谢物数据库Ver. 2版本，它支持采用岛津三重四极杆气质(GC/MS/MS)或四极杆气质(GC/MS)的代谢组学分析。它是基于与岛根大学医学系、神户大学医学院和集成电池材料科学研究所(iCeMS)、京都大学的共同合作，且结果来自于NEDO(New Energy and Industrial Technology Development Organization)项目“促进人类干细胞工业应用的基础技术”。

　　该数据库注册化合物类型数量增加至511个。此外，它现在还包括来自于血液和细胞，以及尿液的生物样品。它是世界上第一款包含代谢物TQ GC/MS MRM的数据库。它包含适合低分子量代谢产物测量的GC条件，以及每种化合物最佳的GC/MS和GC/MS/MS测定的参数。这使研究人员能够立即开始分析工作，而不需要任何复杂的参数设置。该数据库还包含预测计算的保留时间保留指数，允许即使没有代谢产物标准样品也可以开始分析。它支持代谢疾病、药物评估和研究，还将为生物燃料和农产品生产改善作出贡献。