遗传相互作用(genetic interactions，GI)是所有生物体重要生物功能的基础。比如信号通路中，蛋白的相互作用，酶与底物间的相互反应，都属于这一类相互作用，他们对生物体的诸多功能有显著影响。

现在常用的分子间相互作用网站有很多，今天给大家推荐的MIST功能更为全面。

MIST（Molecular Interaction Search Tool）

https://fgrtools.hms.harvard.edu/MIST/

MIST是由哈佛大学医学院推出的一款可以进行分子间相互作用分析的网站，除了名校出品以外，网站目前还一直在更新，第五版的更新是在今年四月份推出的，相比其他长时间不更新的网站来说，这个网站的信息更为全面。

网站覆盖了多达10种生物的数据库资源，包括人、果蝇、小鼠、大鼠、斑马鱼、裂殖酵母、酿酒酵母、非洲爪蟾（Xenopus laevis和Xenopus tropicalis）。支持单基因和多基因检索，图片下方可以选择产生的网络图的类型，比如蛋白-蛋白相互作用（PPI）等。同时，根据自身需要选择筛选条件，进而产生需要的图片。

提交之后几秒钟，我们就能看到上图所示的网络图，所查基因或蛋白就位于中心，每一个椭圆就是相互作用的蛋白。椭圆的节点会标识出不同的颜色进行高亮，代表着不同的相互作用类型。右侧会呈现出该蛋白所在的信号通路和发挥的主要功能，点击不同的的生物学过程，就能看到在这个过程中目标蛋白与哪些蛋白产生了相互作用，并且会用不用颜色的圆圈高亮出来。

具体的相互作用信息会在网络图的下方以表格的形式呈现出来，点击后方链接可以得到更为具体的信息。不同的相互作用蛋白或分子会有一个打分，如果相互作用得到多种实验方法的支持和/或在多种出版物中得到证明，则定为High等级。如果不符合这些标准，但相互作用得到了另一个物种的数据支持，则被赋予moderate等级。对于interologs，如果相互作用是由多个物种的正交基因映射而来，也将其等级定为 "moderate"。

基因间的相互作用也是MIST的一个亮点，指的是一个基因突变的影响可以通过另一基因的突变来改变。这种遗传相互作用主要是从BioGrid，IntAct，DroID和FlyBase收集的。以HK2为例搜索，并没有看到相关的结果显示，这说明还没有数据显示哪个基因突变能够影响到HK2。

当我们更换为TP53基因的时候，我们可以看到EGFR、MDM2等相关基因对TP53的确产生了影响，有相关的文章可以查询。

网站检索简便，而且响应迅速，有寻找分子间相互作用关系的同学可以使用一下。

最后附上常用的分析分子间作用网站的主要功能，大家可以根据需要选择合适的网站。

相比之下，MIST除了在Functional prediction功能上逊色于STRING，其他方面都表现不错，值得一用。

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上海交通大学 临床检验诊断学博士

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