Organism scope Eukaryotes and eukaryotic viruses
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Feature Key precursor_RNA
Definition 任何还不是成熟RNA产物的RNA形式,可以包括5'clip,5'UTR,CDS,exon,intron,3'UTR和3'clip
Optional qualifiers /citation=[number] /db_xref="<database>:<identifier>" /evidence=<evidence_value> /function="text" /gene="text" /label=feature_label /map="text" /note="text" /partial /standard_name="text" /usedin=accnum:feature_label
Comment 可以是后转录加工RNA形式,如果对RNA是否被加工存在疑问,可用prim_transcript关键词代替
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Feature Key prim_transcript
Definition 最初的,未经过加工的转录子;包括5'clip,5'UTR,CDS,exon,intorn,3'UTR,3'clip
Optional qualifiers /citation=[number] /db_xref="<database>:<identifier>" /evidence=<evidence_value> /function="text" /gene="text" /label=feature_label /map="text" /note="text" /partial /standard_name="text" /usedin=accnum:feature_label
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Feature Key primer_bind
Definition 复制、转录和逆转录起始位点的非共价引物结合位点。包括合成的位点,例如PCR引物结合位点
Optional qualifiers /citation=[number] /db_xref="<database>:<identifier>" /evidence=<evidence_value> /gene="text" /label=feature_label /map="text" /note="text" /partial /standard_name="text" /PCR_conditions="text" /usedin=accnum:feature_label
Comment 这个关键词用来注明此位点是在某段引物分子可结合的序列上,而不是指引物分子本身。PCR成分和反应时间可写在/PCR_conditions qualifiers 中由于PCR反应通常包括引物对,单个 primer_bind关键词可用order()中的两个位置表示,或者用一对primer_bind表示。
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Feature Key promoter
Definition 包括RNA酶结合位点到起始转录位点的在DNA分子上的区域
Optional qualifiers /citation=[number] /db_xref="<database>:<identifier>" /evidence=<evidence_value> /gene="text" /function="text" /label=feature_label /map="text" /note="text" /partial /phenotype="text" /pseudo
/standard_name="text" /usedin=accnum:feature_label
Molecule scope DNA
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Feature Key protein_bind
Definition 在核酸上的非共价蛋白结合位点
Mandatory qualifiers /bound_moiety="text"
Optional qualifiers /citation=[number] /db_xref="<database>:<identifier>" /evidence=<evidence_value> /function="text" /gene="text" /label=feature_label /map="text" /partial /note="text" /standard_name="text" /usedin=accnum:feature_label
(责任编辑:泉水) |