Organism scope        prokaryotes

Molecule scope        DNA

References   [1] Schaller, H., Gray, C., and Hermann, K.  Proc Natl Acad Sci USA 72, 737-741 (1974)
                      [2] Pribnow, D.  Proc Natl Acad Sci USA 72, 784-788 (1974)
                      [3] Hawley, D.K. and McClure, W.R.  "Compilation and analysis of Escherichia coli promoter DNA sequences"  Nucl Acid Res 11, 2237-2255 (1983)
                      [4] Rosenberg, M. and Court, D.  "Regulatory sequences involved in the promotion and termination of RNA transcription"  Ann Rev Genet 13, 319-353 (1979)

--------------------------------------------------------------------------------

Feature Key           -35_signal

Definition           一段在细菌转录单位上游35bp处的保守序列；一致序列=TTGACa[1]或TGTTGACA[2]

 
Optional qualifiers   /citation=[number]
                      /db_xref="<database>:<identifier>"                     
                      /evidence=<evidence_value>
                      /gene="text"
                      /label=feature_label
                      /map="text"
                      /note="text"
                      /partial
                      /standard_name="text"
                      /usedin=accnum:feature_label

Organism scope        prokaryotes

Molecule scope        DNA

References  [1] Takanami, M., et al.  Nature 260, 297-302 (1976)
                      [2] Moran, C.P., Jr., et al.  Molec Gen Genet 186,  339-346 (1982)
                      [3] Maniatis, T., et al.  Cell 5, 109-113 (1975)

--------------------------------------------------------------------------------

Feature Key           -

Definition            "-"是一个无关键词的占位符；当只是为了标记一段区域的需要加以说明或在另一个特征中引用它

Optional qualifiers   /citation=[number]
                      /db_xref="<database>:<identifier>"
                      /evidence=<evidence_value>
                      /function="text"
                      /gene="text"
                      /label=feature_label
                      /map="text"
                      /note="text"
                      /partial
                      /number=unquoted text (single token)
                      /phenotype="text"
                      /product="text"
                      /pseudo
                      /standard_name="text"
                      /usedin=accnum:feature_label

Comment               例如：

                      -    1..17
                      /usedin="X55079:GAA_CDS"

返回页首

Appendix IV: Summary of qualifiers for feature keys

以下是用于描述feature key的所有qualifier列表及其用法。排列格式如下：

Qualifier         qualifier的名称; 如果有"="的话，还需要有数值。
Definition      qualifier的定义。
Value format   qualifer值的格式
Example           例子
Comment         说明

--------------------------------------------------------------------------------

Qualifier         /allele=
Definition      给定基因的等位基因名称
Value format    "text"
Example           /allele="adh1-1"

Qualifier        /anticodon=(pos:  ,aa:  )
Definition      tRNA反义密码子的位置及其代表的氨基酸
Value format    pos:<base_range>,aa:<amino_acid> ，其中base_range指反义密码子的位置，amino_acid是它所代表的氨基酸的简写（三字符）
Example         /anticodon=(pos:34..36,aa:Phe)

Qualifier        /bound_moiety=
Definition      moiety bound
Value format    "text"
Example         /bound_moiety="repressor"

Qualifier         /cell_line=
Definition      细胞系
Value format    "text"
Example           /cell_line="MCF7"

Qualifier          /cell_type=
Definition      细胞类型
Value format    "text"
Example            /cell_type="leukocyte"

Qualifier       /chromosome=
Definition      染色体(如：染色体号码)
Value format    "text"
Example         /chromosome="1"

Qualifier       /citation=
Definition      参考文献
Value format    [integer-number]其中integer-number是该参考文献在该序列中是第几条。在我们的数据库递交过程中，不会出现让你自己填写数值的情况，只要你是先填写参考文献、再填写feature key的话，系统会自动把参考文献的标题列出来，供你选择。
Example         /citation=[3]
Comment         用于显示该feature相关的参考文献，用中括号括起来。

Qualifier       /clone=
Definition      该序列来自那一个号码的克隆
Value format    "text"
Example         /clone="lambda-hIL7.3"
Comment         对一个source应该只有一个对应的克隆号码，如果要标识序列是从多个克隆中来的，应该使用多个source。