Qualifier /mod_base=
Definition 修饰碱基的简称。
Value format modified_base
Example /mod_base=m5c
Comment 如果在修饰/不常用碱基列表中没有想要标记的碱基,则用'/mod_base=OTHER'代替,并加注释'/note="修饰碱基名称"'
Qualifier /note=
Definition 任意附加注释说明。
Value format "text"
Example /note="This qualifier is equivalent to a comment."
Qualifier /number=
Definition 表示遗传因子按5'->3'方向顺序的数字(如,外显子或内含子)
Value format 不带引号的文本
Example /number=4
/number=6B
Comment 文本限于整数,字符或整数和/或字符的组合。任何其他辅助信息在/standard_name中说明.
如: /number=2A
/standard_name="long"
Qualifier /organelle=""
Definition 细胞器。
Value format mitochondrion, nucleomorph, plastid, mitochondrion:kinetoplast,
plastid:chloroplast, plastid:apicoplast, plastid:chromoplast,
plastid:cyanelle, plastid:leucoplast, plastid:proplastid,
Examples /organelle="mitochondrion"
/organelle="nucleomorph"
/organelle="plastid"
/organelle="mitochondrion:kinetoplast"
/organelle="plastid:chloroplast"
/organelle="plastid:apicoplast"
/organelle="plastid:chromoplast"
/organelle="plastid:cyanelle"
/organelle="plastid:leucoplast"
/organelle="plastid:proplastid"
Comments 细胞器限于上面这些值。
Qualifier /organism=
Definition 该物种的系统命名。
Value format "text"
Example /organism="Homo sapiens"
Qualifier /partial
Definition 用来区分完整的序列区域和部分区域。
Value format none
Example /partial
Comment 只用于在位置position中没有指明是部分时,如果position中有'<'或'>'时,已经表示是部分序列,则不能再加/partial。
Qualifier /PCR_conditions=
Definition 整个PCR反应的反应条件说明。
Value format "text"
Example /PCR_conditions="Initial denaturation:94degC,1.5min"
Comment 与primer_bind一起用。
Qualifier /pop_variant=
Definition 序列来源的群体变异体。
Value format "text"
Example /pop_variant="population variant name"
Qualifier /phenotype=
Definition 基因表型。
Value format "text"
Example /phenotype="erythromycin resistance"
Qualifier /plasmid=
Definition 质粒名称。
Value format "text"
Example /plasmid="C-589"
Qualifier /product=
Definition 序列编码的产物名称。
Value format "text"
Example /product="catalase"
Qualifier /protein_id=
Definition 由国际协调组织做的蛋白标识符,该标识符由固定的代码部分(3+5格式,3个字符+5个数字)和一个版本号加"."连接而成。
Value format <identifier>
Example /protein_id="AAA12345.1"
Comment 当编码蛋白的CDS改变时,只有/protein_id的版本号上升,3+5的固定代码部分不变,永久标识该蛋白。/protein_id只有在翻译出合法蛋白的CDS中才有效。
Qualifier /proviral
Definition 表示该序列是病毒整合到宿主基因组的原病毒序列。
Value format none
Example /proviral
Qualifier /pseudo
Definition 假,该特征是此feature key的无功能版本。
Value format none
Example /pseudo
Qualifier /rearranged
Definition 如果序列是DNA而且是免疫球蛋白家族成员,该qualifier表示该序列来自于重排DNA。
Value format none
Example /rearranged
Qualifier /replace=
Definition 表示该序列的feature中间被值"text"所取代。
Value format "text"
Example /replace="a"
Qualifier /rpt_family=
Definition 重复序列,如"Alu"或"Kpn"。
Value format "text"
Example /rpt_family="Alu"
Comment 常用于限定修饰repeat_region,而不是它的组成成分repeat_units。
Qualifier /rpt_type=
Definition 重复序列的组织形式。
Value format tandem, inverted, flanking, terminal, direct, dispersed, and
other
Example /rpt_type=INVERTED
Comment 常用于限定修饰repeat_region,而不是它的组成成分repeat_units。对这些值的定义见Singer, M. Int Rev Cytol 76, 67-112 (1982); Cell 26, 293-95 (1981); Hardman, N. Biochem J 234, 1-11 (1986)或更新的版本。
Qualifier /rpt_unit=
Definition 组成repeat_region的重复单位。
Value format <feature_label> or <base_range>
Example /rpt_unit=Alu_rpt1
/rpt_unit=202..245
Comment 用于描述组成repeat_region的重复单位的特征。
Qualifier /sequenced_mol=
Definition 序列的分子类型。
Value format "text"
Example /sequenced_mol="cDNA to mRNA"
Comment 值限制在"cDNA", "cDNA to genomic RNA", "cDNA to mRNA",
"cDNA to other RNA", "cDNA to rRNA", "DNA", "mRNA", "RNA",
"rRNA", "scRNA", "snRNA", "tRNA".
Qualifier /serotype=
Definition 根据抗原性而定的变种(通常是病毒和细菌)。
Value format "text"
Example /serotype="B1"
Comment 主要和source一起用。
Qualifier /sex=
Definition 性别。
Value format "text"
Example /sex="female"