Qualifier /mod_base= Definition 修饰碱基的简称。 Value format modified_base Example /mod_base=m5c Comment 如果在修饰/不常用碱基列表中没有想要标记的碱基,则用'/mod_base=OTHER'代替,并加注释'/note="修饰碱基名称"'
Qualifier /note= Definition 任意附加注释说明。 Value format "text" Example /note="This qualifier is equivalent to a comment."
Qualifier /number= Definition 表示遗传因子按5'->3'方向顺序的数字(如,外显子或内含子) Value format 不带引号的文本 Example /number=4 /number=6B Comment 文本限于整数,字符或整数和/或字符的组合。任何其他辅助信息在/standard_name中说明. 如: /number=2A /standard_name="long"
Qualifier /organelle="" Definition 细胞器。 Value format mitochondrion, nucleomorph, plastid, mitochondrion:kinetoplast, plastid:chloroplast, plastid:apicoplast, plastid:chromoplast, plastid:cyanelle, plastid:leucoplast, plastid:proplastid, Examples /organelle="mitochondrion" /organelle="nucleomorph" /organelle="plastid" /organelle="mitochondrion:kinetoplast" /organelle="plastid:chloroplast" /organelle="plastid:apicoplast" /organelle="plastid:chromoplast" /organelle="plastid:cyanelle" /organelle="plastid:leucoplast" /organelle="plastid:proplastid" Comments 细胞器限于上面这些值。
Qualifier /organism= Definition 该物种的系统命名。 Value format "text" Example /organism="Homo sapiens"
Qualifier /partial Definition 用来区分完整的序列区域和部分区域。 Value format none Example /partial Comment 只用于在位置position中没有指明是部分时,如果position中有'<'或'>'时,已经表示是部分序列,则不能再加/partial。
Qualifier /PCR_conditions= Definition 整个PCR反应的反应条件说明。 Value format "text" Example /PCR_conditions="Initial denaturation:94degC,1.5min" Comment 与primer_bind一起用。
Qualifier /pop_variant= Definition 序列来源的群体变异体。 Value format "text" Example /pop_variant="population variant name"
Qualifier /phenotype= Definition 基因表型。 Value format "text" Example /phenotype="erythromycin resistance"
Qualifier /plasmid= Definition 质粒名称。 Value format "text" Example /plasmid="C-589"
Qualifier /product= Definition 序列编码的产物名称。 Value format "text" Example /product="catalase"
Qualifier /protein_id= Definition 由国际协调组织做的蛋白标识符,该标识符由固定的代码部分(3+5格式,3个字符+5个数字)和一个版本号加"."连接而成。 Value format <identifier> Example /protein_id="AAA12345.1" Comment 当编码蛋白的CDS改变时,只有/protein_id的版本号上升,3+5的固定代码部分不变,永久标识该蛋白。/protein_id只有在翻译出合法蛋白的CDS中才有效。
Qualifier /proviral Definition 表示该序列是病毒整合到宿主基因组的原病毒序列。 Value format none Example /proviral
Qualifier /pseudo Definition 假,该特征是此feature key的无功能版本。 Value format none Example /pseudo
Qualifier /rearranged Definition 如果序列是DNA而且是免疫球蛋白家族成员,该qualifier表示该序列来自于重排DNA。 Value format none Example /rearranged
Qualifier /replace= Definition 表示该序列的feature中间被值"text"所取代。 Value format "text" Example /replace="a"
Qualifier /rpt_family= Definition 重复序列,如"Alu"或"Kpn"。 Value format "text" Example /rpt_family="Alu" Comment 常用于限定修饰repeat_region,而不是它的组成成分repeat_units。
Qualifier /rpt_type= Definition 重复序列的组织形式。 Value format tandem, inverted, flanking, terminal, direct, dispersed, and other Example /rpt_type=INVERTED Comment 常用于限定修饰repeat_region,而不是它的组成成分repeat_units。对这些值的定义见Singer, M. Int Rev Cytol 76, 67-112 (1982); Cell 26, 293-95 (1981); Hardman, N. Biochem J 234, 1-11 (1986)或更新的版本。
Qualifier /rpt_unit= Definition 组成repeat_region的重复单位。 Value format <feature_label> or <base_range> Example /rpt_unit=Alu_rpt1 /rpt_unit=202..245 Comment 用于描述组成repeat_region的重复单位的特征。
Qualifier /sequenced_mol= Definition 序列的分子类型。 Value format "text" Example /sequenced_mol="cDNA to mRNA" Comment 值限制在"cDNA", "cDNA to genomic RNA", "cDNA to mRNA", "cDNA to other RNA", "cDNA to rRNA", "DNA", "mRNA", "RNA", "rRNA", "scRNA", "snRNA", "tRNA".
Qualifier /serotype= Definition 根据抗原性而定的变种(通常是病毒和细菌)。 Value format "text" Example /serotype="B1" Comment 主要和source一起用。
Qualifier /sex= Definition 性别。 Value format "text" Example /sex="female"
(责任编辑:泉水) |