Modified and unusual Amino Acids

        Abbreviation    Amino acid
        ------------    ---------

        Aad             2-Aminoadipic acid
        bAad            3-Aminoadipic acid
        bAla            beta-Alanine, beta-Aminoproprionic acid
        Abu             2-Aminobutyric acid
        4Abu            4-Aminobutyric acid, piperidinic acid
        Acp             6-Aminocaproic acid
        Ahe             2-Aminoheptanoic acid
        Aib             2-Aminoisobutyric acid
        bAib            3-Aminoisobutyric acid
        Apm             2-Aminopimelic acid
        Dbu             2,4-Diaminobutyric acid
        Des             Desmosine
        Dpm             2,2'-Diaminopimelic acid
        Dpr             2,3-Diaminoproprionic acid
        EtGly           N-Ethylglycine
        EtAsn           N-Ethylasparagine
        Hyl             Hydroxylysine
        aHyl            allo-Hydroxylysine
        3Hyp            3-Hydroxyproline
        4Hyp            4-Hydroxyproline
        Ide             Isodesmosine
        aIle            allo-Isoleucine
        MeGly           N-Methylglycine, sarcosine
        MeIle           N-Methylisoleucine
        MeLys           6-N-Methyllysine
        MeVal           N-Methylvaline
        Nva             Norvaline
        Nle             Norleucine
        Orn             Ornithine
        Sec             Selenocysteine
        OTHER           (requires /note=)
12.Reference: 这里可以加入所有与该递交序列相关的参考文献。
注：缺省的reference 1是" the Biosino Direct Submit", 请不要试图去更改reference 1为其他参考文献，因为系统拒绝你对reference 1的其他项目 "Volume","Issue","StartPage","EndPage" 和 "Year"等进行任何改动。对于reference 1只要输入所有的作者就可以了。通过点击append来输入第二条参考文献。
参考文献由两部分组成："Reference"和"Authors"。先用"Reference"部分的"Append"命令加入新的参考文献，然后用"Authors"部分的" append"命令加入所有的作者信息，最后用"Submit"将数据传到数据库中。
12-1 Reference-List: 本框显示所有的与该序列相关的参考文献，点击其中的一条，文献和相应的作者信息会在显示在屏幕上。
12-2 Reference-Reference Dbname:
12-3 Reference-Position: 指出该参考文献所涉及该序列的那一部分，即位置。需要注意的是该位置指的是递交给数据库的序列上的位置（从5'向3'方向），不是作者在参考文献中的位置。

位置描述方法
位置可以用以下任何一种方法描述：

(a) a single base number
(b) a site between two indicated base numbers
(c) a single base chosen from within a specified range of bases
(d) the base numbers delimiting a sequence span
(e) a remote entry identifier followed by a local location descriptor
    (i.e., a-d)

两个核苷酸间的位置（如内切酶切点）用两点位置间加"^"表示。

某段碱基范围内的某个碱基用起始碱基位置终止碱基位置间加一个"."表示。如 '(12.21)'表示位于12位和21位碱基间的某一个碱基。"<"和">"表示位置在特定碱基以外的地方。

某段碱基序列范围用两个碱基位置间加两个"."表示，如34..456。'<'和'>'可以分别放在起始和终止碱基位置表示位置已经超出指定的碱基位置（但不包括这个碱基）。起始和终止位置可以用碱基的位置表示，如34..456；也可以用相应的运算符运算表示。

运算符
位置运算符是一个位置运算的前缀，通过对其包括序列的运算得到真正表示的序列。

complement(location)
"location"位置所表示的序列的互补链。

join(location,location, ... location)
将由各个location所表示的序列首尾连接成一个连续的序列。

order(location,location, ... location)
仅表示将特定序列排序 (5' －> 3'方向), 但没有任何把这些location所代表的序列连接起来的意思。

位置描述样例
描述                  说明  

467                 指第467位碱基
340..565             指从340位到565位范围的碱基区域（包括两个边界碱基）
<345..500            从345位前（不包括345位）的某个碱基开始一直到500位之间的碱基区域。
<1..888              从第1位碱基前的某个碱基开始到第888位碱基间的区域。
(102.110)            第102位到第110位碱基间的某一个碱基，具体是那一个不清楚。
(23.45)..600         从第23位到第45位间的某个不清楚的碱基开始到第600位碱基间的区域。
(122.133)..(204.221)  从第122位到第133位间的某个不清楚的碱基开始，到从第204位到第221位碱基间的某个不清楚的碱基结束的一个碱基区域。
123^124              第123位和第124位碱基间的某个地方（不是碱基本身）。  
145^177              第145到177位间的某两个相邻碱基间的某个地方（不是这两个相邻碱基本身），具体是那两个相邻碱基不清楚。
join(12..78,134..202)  由第12位到第78位的碱基区域与第134位到第202位的碱基区域连接而成一个连续的碱基序列。
complement(join(2691..4571,4918..5163))
                    将第2691位到第4571位的碱基区域与第4918位与第5163位的碱基区域连接起来所得到的连续区域的互补链上对应区域。
join(complement(4918..5163),complement(2691..4571))
                    将第4918位到5163位区域互补链上的序列与第2691位到第 4571位碱基区域互补链上的序列连接起来得到的序列。
                       注：该表达式与前一个表达式所表示的是同一段序列。
complement(34..(122.126))开始于第34位终止于第122位到第126位某个不清楚的碱基的碱基序列的互补链上的序列。
J00194:(100..202)      指数据库中注册号为J00194的序列中第100位到第202位间的序列。

12-4 Reference-Medline: 该参考文献在Medline上的查取号。
12-5 Reference-Status: 该文献的出版状态。
a.Unpublished:正在准备或已经发出的文献，但还没有收到被杂志正式录用的通知的文章。
b.In-Press:已经收到被正式录用通知但还没有出版的文章。
c.Published:已经发表的文章。
12-6 Reference-Title: 文献标题。
12-7 Reference-Journal Index: 从A-Z中选择杂志的开头字母。选择了一个字母后，以该字母开头的杂志会在Journal下拉菜单中出现。
12-8 Reference-Journal: 该参考文献发表的杂志。此处给出Biosino数据库中开头字母为在Journal Index中所选的杂志。如果你的文章发表在非本数据库杂志中，请选择"other"并在feature key和qualifier中做出注释。也可以用电子邮件、传真或电话通知我们，我们会将该杂志加入到杂志库中。
12-9 Reference-Volume: 该参考文献发表在杂志的那一卷。
12-10 Reference-Issue: 该参考文献发表在哪一期。
12-11 Reference-Startpage: 该参考文献在杂志中的开始页码。
12-12 Reference-Endpage: 该参考文献在杂志中的最后页码。
12-13 Reference-Year: 该杂志是哪一年出版的。
注意点:
不管参考文献有没有发表，一定要给该文献一个标题（至少一个词）。
参考后面的说明填写作者信息。任何参考文献的作者至少要包括一个该序列的递交作者，否则需在引用该文献的feature key(如misc_difference, allele, exon) 中说明。序列递交的作者也就是参考文献为"Direct submission to Biosino Database"所列的作者。
文献的状态是In-Press或Published时，Title和Year区域是必须填写的。
文献的状态是Published的话， Volume和Startpage，Endpage必须填写。
操作: 总共有五个操作: append, delete,update, restore, submit.
Append: 再加一条参考文献。
Delete: 将该文献加一个删除的标记。
Update: 更新参考文献的数据。
Restore: 将已标记为删除的文献恢复.
Submit: 将文献的改动发送到数据库，从而更新数据库中该文献的数据。在submit前所有的数据的改动都没有反应到数据库中。
12-14 Author-List: 显示从Reference-List(12-1)中选择的参考文献的作者列表。
12-15 Author-First name: 作者的名。
12-16 Author-Mid. name: 对非中国人来说的middle name。
12-17 Author-Last name: 作者的姓。
12-18 Author-emai: 作者的email地址。
12-19 Author-Tel: 作者的电话号码。该号码包括国家代码、地区长途代码、本地号码以及分机。如. 86-21-64310242-5388
12-20 Author-Fax: 作者的传真号码，号码要求同电话号码。
12-21 Author-Organization: 作者的单位名称。如Bioinformation Center, Shanghai Institutes for Biological Sciences, Chinese Academy of Sciences.
12-22 Author-Address: 单位地址，如Yueyang Road No.319, Shanghai, China, 200031
操作: 总共有四种操作: append, delete,update, restore, submit. 这些操作的含义同前面对Refrence的说明.
12-23 Back: 完成所有的参考文献的编辑返回到序列具体信息编辑菜单。
13. Key Words: 增加该序列的关键词。
13-1. Key Words-List: 所有的关键词列表，包括加入的关键词和已经标记为删除的关键词。
13-2. Key Words-Key Word: 填入一个与序列有关的关键词。
操作: 总共有五个操作: append, delete,update, restore, submit. 这些操作的含义同前面对Reference的说明。
13-3. Key Words-Back: 完成对关键词的编辑，会到详细信息编辑菜单。
14. Patent: 增加该序列相关的专利信息。
14-1. Patent-List: 所有的专利列表。
14-2. Patent-Patent Name: 与序列相关的专利名称。
14-3. Patent-Country: 专利授予国家或机构。
14-4. Patent-App. No. : 专利申请号码。
14-5. Patent-App.Date: 专利申请日期。日期格式为yyyy-mm-dd, 如. 2000-3-20.
14-6. Patent-Pub. No.: 专利公布号。
14-7. Patent-Pub. Date: 专利公布日期。
14-8. Patent-Patent No.: 正式授予的专利号。
14-9. Patent-Patent Date: 正式授予专利的日期。
操作: 总共有五个操作: append, delete,update, restore, submit. 这些操作的含义同前面对Reference的说明。
14-10. Patent-Back: 完成对专利的编辑，会到详细信息编辑菜单。
15. International Database: 加入该序列的国际注册号和版本号。
15-1. International Database-List: 列出所有与该序列相关的国际注册号和版本号。
15-2.International Database-Registed ID: 该序列的国际注册号。
15-3. International Database-Version:该序列在国际数据库中的版本号。
操作: 总共有五个操作: append, delete,update, restore, submit. 这些操作的含义同前面对Reference的说明。
15-4. International Database-Back: 完成对国际数据库的编辑，会到详细信息编辑菜单。
16. Comment: 与该序列有关的所有注释。
16-1. Comment-List: 所有的注释列表。
16-2. Comment-comment: 填入新的注释。
操作: 总共有五个操作: append, delete,update, restore, submit. 这些操作的含义同前面对Reference的说明。
16-3. Comment-Back. 完成对注释的编辑，会到详细信息编辑菜单。
17. Feature-Keys: 加入与该序列或该序列的部分序列相关的特征。
17-1. Feature key-Please select a feature key : 总共有两个下拉菜单。从第一个下拉菜单选择想填写的序列特征，你会看到右边有对该特征的简单描述。从第二个下拉菜单中选择new来增加一个特征或是点击一个数字来编辑修改原来的序列特征描述。
当你选择增加或修改序列特征时，有很多描述该特征的描述词（qualifer）会动态显示出来，在其右边也有简单的在线提示。请仔细填写所有该填的qualifiers，然后按下"submit"，将该序列特征储存在数据库中，带有"*"的qualifer是必填的项目。
注意: 序列特征"souce"是必须填的，且最好一开始就填写。
对所有的序列特征（feature key）和描述词（qualifier）的定义和填写格式见 完整的用户手册.
17-2 Feature key-Back: 完成对feature key的编辑，会到详细信息编辑菜单。